Nghiên cứu sử dụng thực khuẩn thể trong phòng trị bệnh thối hạt lúa Môn Chính sách và ứng dụng kinh tế vĩ mô | Trường Học Viện nông nghiệp Việt Nam

TRANG THÔNG TIN VỀ LUẬN ÁN
Tên luận án: “Nghiên cứu sử dụng thực khuẩn thể trong phòng trị bệnh thối
hạt trên lúa do vi khuẩn Burkholderia glumae”
Chuyên ngành: Bảo vệ Thực Vật Mã ngành: 62 62 01 12
Họ tên nghiên cứu sinh: Đoàn Thị Kiều Tiên
Người hướng dẫn chính: PGS.TS. Nguyễn Thị Thu Nga
Người hướng dẫn phụ: PGS.TS. Trần Thị Thu Thủy
Cơ sở đào tạo: Trường Đại học Cần Thơ.
1. Tóm tắt nội dung luận án
Luận án được thực hiện trong điều kiện phòng thí nghiệm Bệnh cây và nhà lưới
thuộc Bộ môn Bảo vệ thực vật, Khoa Nông nghiệp, Trường Đại học Cần Thơ, vùng
trồng lúa tại tỉnh Vĩnh Long và Viện Kỹ Thuật Kyoto Nhật Bản từ 2015 đến 2019.
Luận án “Nghiên cứu sử dụng thực khuẩn thể trong phòng trị bệnh thối hạt trên lúa do
vi khuẩn Burkholderia glumae” nhằm tuyển chọn những dòng thực khuẩn thể triển
vọng có hiệu quả trong phòng trị bệnh thối hạt lúa do vi khuẩn B. glumae ở điều kiện
ngoài đồng, từ đó khẳng định hiệu quả của biện pháp sinh học sử dụng thực khuẩn thể
trong quản lý bệnh thối hạt lúa, góp phần giảm lượng thuốc hóa học trong môi trường.
Luận án được hoàn thành với các nội dung chính như sau:
Nội dung một là phân lập, tuyển chọn thực khuẩn thể và vi khuẩn gây bệnh thối
hạt lúa. Phân lập được 112 dòng thực khuẩn thể và 60 dòng vi khuẩn gây bệnh thối hạt
lúa tại chín tỉnh đồng bằng sông Cửu Long của Việt Nam. Đã chọn được 8 dòng thực
khuẩn thể (ФBurTV25a, ФBurDT46, ФBurDT47a, ФBurDT47b, ФBurDT48a,
ФBurVL34, ФBurVL39, ФBurAG58) có phổ kí sinh rộng trên nhiều dòng vi khuẩn
gây bệnh thối hạt (chiếm khoảng 75% trong tổng số vi khuẩn gây bệnh thối hạt), đồng
thời cũng chọn 6 dòng vi khuẩn (BurVL21, BurDT46, BurDT50; BurDT51, BurKG52,
BurKG57) gây bệnh thối hạt bị nhiều dòng thực khuẩn thể kí sinh (chiếm 55% dòng
thực khuẩn thể kí sinh). Tiếp theo, xác định được 6 dòng vi khuẩn (BurVL21,
BurDT46, BurDT50; BurDT51, BurKG52, BurKG57) gây bệnh thối hạt lúa bằng kỹ
thuật sinh học phân tử với cặp mồi đặc hiệu 1416S/1414A là loài Burkholderia
glumae. Qua đánh giá khả năng gây hại bệnh thối hạt lúa của 6 dòng vi khuẩn B.
glumae (BurVL21, BurDT46, BurDT50; BurDT51, BurKG52, BurKG57) đã tìm ra
dòng vi khuẩn BurDT46 được phân lập tại Đồng Tháp gây bệnh thối hạt cao hơn các
dòng vi khuẩn còn lại. So sánh khả năng phân giải của 8 dòng thực khuẩn thể
(ФBurTV25a, ФBurDT46, ФBurDT47a, ФBurDT47b, ФBurDT48a, ФBurVL34,
ФBurVL39, ФBurAG58) trên vi khuẩn BurDT46 đã xác định được bốn dòng thực
khuẩn thể (ФBurVL 34, ФBurAG58, ФBurDT47a và ФBurDT48a) cho đường kính
phân giải cao hơn các dòng thực khuẩn thể còn lại.
Nội dung hai là đánh giá khả năng phòng trị bệnh thối hạt do vi khuẩn B. glumae
của các dòng thực khuẩn thể triển vọng trong điều kiện nhà lưới. Đầu tiên, khảo sát khả
năng phòng trị bệnh thối hạt lúa do vi khuẩn B. glumae DT46 của bốn dòng thực khuẩn
thể triển vọng (ФBurVL 34, ФBurAG58, ФBurDT47a và ФBurDT48a) với việc xử lý
từng dòng đơn lẽ hay hỗn hợp 4 dòng ở mật số 108 pfu/ml, kết quả cả bốn nghiệm thức xử
lý TKT đơn hay HH TKT đều cho hiệu quả giảm bệnh thối hạt khác biệt với nghiệm thức
đối chứng. Trong đó dòng thực khuẩn thể ФBurAG58 cho hiệu quả giảm bệnh trên 70%
cao hơn các nghiệm thức còn lại. Thứ hai, so sánh hiệu quả của dòng thực khuẩn thể
ФBurAG58 ở bốn mật số khác nhau (105 pfu/ml, 106 pfu/ml, 107 pfu/ml và 108pfu/ml)
trong phòng trị bệnh thối hạt lúa do vi khuẩn B. glumae, kết quả cả bốn mật số thực khuẩn
thể đều có tỷ lệ hạt nhiễm bệnh thấp hơn và khác biệt với nghiệm thức đối chứng, đặc biệt
mật số 108pfu/ml thể hiện hiệu quả phòng trị bệnh tốt nhất với tỷ lệ hạt bệnh thấp hơn và
khác biệt so với các nghiệm thức còn lại. Hơn nữa, xác định được 2 thời điểm áp dụng
thực khuẩn thể gồm phun thực khuẩn thể 2 giờ trước khi lây bệnh, hay phun thực khuẩn
thể kết hợp 2 giờ trước khi lây bệnh và 5 ngày sau khi lây bệnh cho hiệu quả phòng trị
bệnh cao hơn và khác biệt phun thực khuẩn thể 5 ngày sau khi lây bệnh.
Nội dung thứ ba là nghiên cứu định danh các dòng thực khuẩn thể triển vọng
nhằm xác định tính an toàn của TKT khi áp dụng trong thực tế sản xuất. Về mặt hình
thái cả ba dòng thực khuẩn thể (ФBurVL34, ФBurAG58, ФBurDT47a) dưới kính hiển
vi điện tử truyền qua (TEM) đều thuộc họ Podoviridae với đặc điểm đầu là khối đa
diện và đuôi ngắn. Về kết quả giải trình tự bộ genome của ba thực khuẩn thể
ФBurVL34, ФBurAG58, ФBurDT47a với kích thước bộ gen tuần tự là 44.657 bp,
36.275bp và 45.466 bp, đều có % G+C là 58%, đặc biệt cả ba thực khuẩn thể này đều
thuộc nhóm thực khuẩn thể độc (virulent phage hay lytic phages) do bộ gen không có
gen qui định enzyme integrase chỉ thể hiện ở thực khuẩn thể ôn hòa.
Nội dung thứ tư là đánh giá hiệu quả của các dòng thực khuẩn thể triển vọng phòng trị
bệnh thối hạt lúa ở điều kiện ngoài đồng. Đầu tiên, khảo sát hiệu quả của việc xử lý thực khuẩn
thể ФBurAG58 đơn và hỗn hợp 3 dòng TKT (ФBurVL 34, ФBurAG58, ФBurDT47a) ở mật
số 108 pfu/ml với hai lần phun trước và sau khi trổ ở vụ Đông Xuân 2017-2018, kết quả
đã ghi nhận nghiệm thức xử lý TKT ФBurAG58 đơn hay hỗn hợp thực khuẩn thể giảm
bệnh thối hạt tương đương với nghiệm thức xử lý oxolinic axit và khác biệt nghiệm thức đối
chứng với hiệu quả giảm bệnh khoảng 50%, góp phần bảo vệ tỷ lệ hạt chắc và năng suất lúa.
Thứ hai, khảo sát hiệu quả của nghiệm thức xử lý thực khuẩn thể ФBurAG58 đơn và HH TKT
(ФBurVL 34, ФBurAG58, ФBurDT47a) ở hai mật số 107 pfu/ml và 108 pfu/ml, kết quả
ФBurAG58 (108pfu/ml) và hỗn hợp thực khuẩn thể (108pfu/ml) cho hiệu quả giảm bệnh thối
hạt lúa cũng tương đương với nghiệm thức oxolinic axit với hiệu quả giảm bệnh khoảng 50%.
Nội dung thứ năm là khảo sát điều kiện nhân nuôi thực khuẩn thể ФBurAG58
trong điều kiện phòng thí nghiệm. Kết quả ghi nhận môi trường King’s B lỏng, Nutrient lỏng,
PDA + Peptone lỏng cho mật số thực khuẩn thể cao hơn và khác biệt với môi trường PDA
lỏng. Tiếp tục khảo sát thời gian cấy vi khuẩn kí chủ trước hay cùng lúc với thời gian cấy TKT
lên khả năng nhân nuôi thực khuẩn thể ФBurAG58 trên hai dạng môi trường King’s B (King’s
B lỏng và King’B 0,8% agar). Kết quả thực khuẩn thể ФBurAG58 cho mật số cao trong môi
trường King’s B lỏng ở điều kiện cấy vi khuẩn B. glumae trước 16 giờ sau đó bổ sung thực
khuẩn thể. Ngoài ra, tìm ra chỉ số MOI là 1,0 cho log mật số thực khuẩn thể đạt giá trị
10,00 (tương ứng 1010 pfu/ml) cao hơn chỉ số MOI 0,01 và MOI 0,1. Cuối cùng, nhiệt độ
300C cho log mật số thực khuẩn thể cao hơn và khác biệt với hai nhiệt độ 270C và 370C vào
thời điểm 24 giờ sau khi nhân nuôi.
2. Những kết quả mới của luận án -
Xác định vi khuẩn gây bệnh thối hạt chủ yếu trên lúa ở ĐBSCL là do loài
Burkholderia glumae -
Xác định được ba dòng thực khuẩn thể có tiềm năng cao trong phòng trị bệnh
thối hạt ở điều kiện ngoài đồng với hiệu quả giảm bệnh trên 50% tương đương thuốc
hóa học. Ba dòng thực khuẩn thể này được xác định thuộc nhóm thực khuẩn thể độc
(virulent phages) nên đạt tính an toàn trong quản lý bệnh thối hạt do vi khuẩn B. glumae. -
Xác định được điều kiện nhân nuôi tối hảo của dòng thực khuẩn thể triển vọng
đạt được mật số cao tương đương 1010 pfu/ml, có thể đáp ứng được yêu cầu sử dụng trên diện rộng.
3. Khả năng ứng dụng trong thực tiễn, các vấn đề cần tiếp tục nghiên cứu
- Khả năng ứng dụng trong thực tiễn
Kết quả nghiên cứu sẽ góp phần mở ra chiến lược quản lý bệnh do vi khuẩn
theo hướng thân thiện với môi trường, đặc biệt bệnh thối hạt lúa tại Việt Nam. Đồng
thời kết quả cũng thấy khả năng ứng dụng thực khuẩn thể mang tính khả thi dựa vào
hiệu quả giảm bệnh và phương pháp nhân nuôi.
- Các vấn đề cần tiếp tục nghiên cứu
- Tiếp tục nghiên cứu khảo nghiệm hiệu quả của hỗn hợp thực khuẩn thể trong
phòng trừ bệnh thối hạt trên diện tích rộng ở nhiều tỉnh ĐBSCL
- Cần tiếp tục nghiên cứu điều kiện tồn trữ chế phẩm thực khuẩn thể dài hạn ở
nhiệt độ phòng góp phần đưa ứng dụng thực khuẩn thể tiếp cận thực tiễn.
Người hướng dẫn
Nghiên cứu sinh
PGS.TS. Nguyễn Thị Thu Nga Đoàn Thị Kiều Tiên
Xác nhận của
Thủ trưởng đơn vị đào tạo sau đại học