LÊ DUY THÀNH (Ch biên)
Đ THNG - ĐINH ĐOÀN LNG
TRN TH HNG
^ 9 NHÀ XUT BẢN GC DC
LÊ DUY THÀNH (Ch biên)
Đ LÊ THĂNG - ĐINH ĐOÀN LONG - TRÂN TH HONG
Cơ S
SINH HC PHÔN T
(Tái bn ln th nht)
NHÀ XUT BN GIÁO DUC
ng ty c phần ch Đi học - Dy nghề - Nhà xuất bn Giáo dục giữ quyến
công b tác phẩm.
Mi tổ chc, nhân muốn s dng tác phẩm ới mọi hình thc phi đưoc s đóng
ý
của
chs hữu quyền tác gi.
04 - 2009/CXB/528 - 21 17/GD
Mã s : 7K 784\9 - D-\I
LỜI nói đu
MC LC
3
Phn mt
CÁC LOI TẾ BÀO VÀ CÁC ĐI PHÂN TỬ
Chương 1. Các loại tè bào các đi phàn t...........................................................9
1.1. Phân loi tế bào...........................................................................................9
1.2. Các bào quan............................................................................................. 12
1.3. Các đi phàn t..........................................................................................15
1.4. S tp hp c đi phân t
....................................................................... 18
Phn hai
CU TRÚC, CHC NG VÀ PHƯƠNG PHÁP PHÂN TÍCH PROTEIN
Chương 2. Cu trúc, chức ng và phưong pháp phân tích protein
............
21
2.1. Axit am in...................................................................................................22
2.2. Cấu trúc và chc năng ca protein
.........................................................24
2.3. Phân ch protein.......................................................................................31
Phn ba
CU TRÚC VÀ ĐNG THÁI CA ADN
Chương 3. Axit deoxyribonucleic (ADN)................................................................35
3.1. hình cu trúc ADN cùa Watson và Crick
.......................................
36
3.2. Tnh phần hoá hc ca ADN................................................................41
3.3. Cấu trúc của ADN.....................................................................................42
3.4. Một sô' đc điểm vt lý của ADN............................................................46
3.5. Chức năng sinh hc ca ADN.................................................................49
3.6. Khái niệm v gen......................................................................................50
Clìươiìg 4. Tái bn cùa AD N ........................................................................................52
4.1. c mô nh tái bản ADN: bo toàn, bán bảo toàn và phàn tán
........
53
4.2. Các thành phần cần thiết cho s tái bản ADN prokaryote
.............
58
4.3. Tái bản ADN si kép à prokaryote.......................................... 66
3
4.4. Tái bản ADN eukaryote.......................................................................73
4.5. Tính chính xác của quá trình tái bn......................................................74
Chương 5. Tái bản ca các loại axit nucleic khác
................................................
7
5.1. chế tái bản adn mạch đơn ca phage 0X174
..................................
77
5.2. Tng hợp ARN mch đơn virut khảm thuốc lá
.................................82
5.3. ARN m khn cho vic tng hp ADN Retrovirut - HIV
..........
84
5.4. Phage lambcla và hin tưng tim tan....................................................^
Cơng 6. Đt biến sửa cha A D N
..................................................................... 95
6.1. Khái niệm v đt biến.............................................................................. 96
6.2. Các cơ chế đt biến...................................................................................96
6.3. Tần số đột biến.........................................................................................102
6.4. Phân lp đột biến..................................................................................... 103
6.5. Các đột biến thầm lặng........................................................................... 105
6 .6 . Các tác nhân y đt biến......................................................................106
6.7. Những hậu quả của quá trình đt biến.................................................111
6 .8 . Sa cha ADN.......................................................................................... 114
Cơng 7. Bản cht ca gen....................................................................................... 122
7.1. Định nghĩa v gen....................................................................................122
7.2. Kích thưc của gen.................................................................................. 123
7.3. Nghịch lý của g tr c ............................................................................124
7.4. Thông tin trong gen................................................................................. 125
7.5. Gen cu trúc..............................................................................................126
7.6. Các yếu tố điều hoà................................................................................. 130
7.7. Gen mã hoá các protein và ARN........................................................... 132
Phn bn
K THUT THAO TÁC TRÊN ADN
ClìUơng 8. K thut PC R............................................................................................. 134
8.1. Các giai đoạn ca PCR............................................................................134
8.2. Các điều kiện ca phn úna PCR..........................................................139
8.3. Các ADN polymerase chu nhit...........................................................142
8.4. ADN khuôn...............................................................................................143
8.5. Mồi oligonucleotit................................................................................... 144
8 .6 . Ghép đôi sai của mi...............................................................................45
8.7. PCR trong vic chẩn đoán bệnh di truyn................................... ......147
8 .8 . Tách dòng các sán phẩm PCR...............................................................150
4
8.9. R T -P C R ................................................................................................151
8 .10. Real-tim e PCR................................................................................... 152
Cơng 9. Các vec tách dòng
...............................................................................
9.1. Thiết kế các vectơ plasmit.....................................................................154
9.3. Cosmit và nhim sc th nm men nhân to......................................163
9.4. Các vectơ cho sinh vt eukaryote.........................................................167
Chương 10. Tách dòng gen.........................................................................................172
10.1. Xây dng thư vin h gen....................................................................173
10.2. Xây dng thu vin cADN (cDNA library)
.......................................
179
10.3. Tách dòng cADN theo chiu xác đnh
..............................................183
10.4. Xây dng thư vin gen da trên PCR................................................185
10.5. Xây dng thư vin gin lưc...............................................................187
10.6. Xây dng thư vin gen sau d án gii mã h gen............................190
Chương 11. Phân tích gen và hệ gen............................
.........................................
191
11.1. Các gen trong h gen............................................................................191
11.2. Giai trình t ba nitơ trong ADN......................................................194
11.3. Gii trình t h gen.........................................................................205
11.4. D án h gen ngưi..............................................................................207
11.5. Tìm và xác định v trí gen...................................................................215
11.6. Xác định vai trò và chc năng gen.....................................................216
11.7. Tin sinh hc............................................................................................218
Phn nãm
MÃ DI TRUYN - BIU HIN CA GEN
VÀ ĐIU HOÀ S BIU HIN CA GEN
Chương 12. Mã di truyn............................................................................................220
12.1. di truyền có tính thoái hoá
...........................................................
220
12.2. Ba nguyên tc điu khiến mã di truyn
.............................................229
12.3. Đột biến c chế có th nm trong ng gen, hoc khác gen
.........
231
12.4. Tính vn ng ca di truyn
......................................................... 234
Cơng 13. Biêu hiện gen sinh vậí prokaryote.................................................237
13.1. Môi liên h gia ADN, ARN và protein...........................................238
13.2. Protein/polypeptit và hot tính sinh hc
...........................
:
...............
239
13.3. Nhu cầu năng lưng trong q trình tổng họp protein
...................
242
13.4. Các thành phn tham gia tổng hp protein........................................243
13.5. Quá trình tng hp protein
.................................................................. 253
13.6. Phiên mã.................................... 255
13.7. Dịch m ã
...............................
261
13.8. S cuộn xon của protein
.....
...266
Chương 14. Điêu hoà bu hiện gen sinh vật prokaryote
..............................
268
14.1. Điều hoà trao đi cht
............
.......................
269
14.2. Điều hoà hoạt động ca tế bào
...............
...........................
270
14.3. c Operon lac, trp, ara.......................................................................274
Chương 15. Cu trúc biểu hiện của gen sinh vt eukaryote
..................299
15.1. ADN và nhiễm sc th sinh vt eukaryote
....................................
299
15.2. Protein histon và protein phi histon
.................................................... 303
15.3. S đóng gói của ADN.......................................................................... 304
15.4. Gen sinh vt eukaryote......................................................................306
15.5. Hiện tượng methyl hoá các gen...........................................................309
15.6. c enzym ARN polymerase I, II và III.............................................311
15.7. Q trình cắt ni của ARN...................................................................313
15.8. Những biến đi sau phn mã ca ARN.............................................321
15.9. Điều hoà hoạt động gen bi protein................................................... 323
15.10. Điều hoà hoạt đng gen bi ARN.....................................................325
Tài liệu tham kho................................................................................................... 331
6
Trong khong 3 thp k qua, chúng ta đã tri qua mt cuộc cách
mng kiên thc v nhng vân đ liên quan đến các quá trình lưu tr,
truyn đt và biu hin ca thông tin di truyn mc đ phân tử.
Các kiên thc ca sinh học phân t cho phép chúng ta gii thích
được môi quan h gia cu trúc và chức năng ca các phân t sinh học
cũng như s vn hành và kim soát các quá trình hoá sinh trong tế bào.
Tâm điếm ca sinh học phân t là việc nghiên cu các đi phân t và
các phc h đi phân t ca ADN, ARN và protein cùng các quá trình
tái bn, phiên mã và dch mã.
Trong s các tiến bộ k thut p phn to ra cuc bùng n v kiến
thc nói trên, thì trưc tiên phi k đến nhng thành tu ca k thut
di truyn hay thao tác gen. nhm to ra các phân t ADN tái t hp đề
có thê ng dng trong lĩnh vực chuyn gen. Nó không ch góp phn cng
cô các kiến thc cơ bn mà còn được áp dng đ to ra các sinh vt
chuyên gen. sn xut ra các sn phm an toàn s dng trong y học, thc
phm, chn đoán các bnh di truyn và liu pháp gen ngưi. Điu này
khiến cho mt s quan nim vn còn ng tr cách đây không lâu ca
chúng ta v kh năng ng dng các thành tu ca sinh hc phân t vào
thc tin, đã thay đi. Chng hn. vào thp k 70 ca thế k XX, vic đ
xut ra ý tưng phân lp gen hay s dng liu pháp gen đ cha chy
các bnh nan y cho con ngưi được coi là vin vông, thì ngàv nay nó đang
hin hu, hoc đang dn tr thành hin thc. Theo d báo ca Vin
nghiên cu quc gia M v gen ngưi ttyì. đến khong năm 2010. ngưi
ta s tìm ra các khiêm khuvêt gen mt sô bnh him nghèo như ung
thư. đt qu. Parkinson. Anzheimer, AIDS,... và dùng liu pháp gen đ
điu tr. Đến năm 20lõ s mở rng phương pháp điu tr và s dng liu
pháp gen da theo bn đ gen ca bnh nhân. T sau năm 2025 s điu
chnh các khuyết tt di truyn người bng liu pháp gen.
Nội dung cua cun sách này đã đưc la chn đ phn ánh nhng
thành tu thuyết cũng như nhng kỹ thut cơ bn áp dng vào việc
phân tích các quá trình sinh học mc đ phân tử.
I
Cuôn sách có 15 chương thuc 5 phn chính như sau:
Phân mt (chương 1) gii thiu vê các loại tê bào prokaơ°^e
eukaryote và các đi phân t.
Phn hai (chương 2) đ cp đến cu trúc, chc năng cúa protein và
phương pháp phân tích chúng.
Phn ba (chương 3, 4, 5, 6 , 7) tho lun về cu trúc và đng thái
ca ADN trong quá trình hot động. Ngoài ra, bn cht ca gen cũng
được đ cp đến đây.
Phn bôn (chương 8 , 9, 10, 11) trình bày các nguyên mt lý
thuyết và nguyên tc ca các k thut cơ bn trong thao c ADN. ơ đây,
k thut PCR, mt sô" loại vectơ tách ng dùng cho sinh vt prokaryote
cũng như eukaryote, các phương pháp cơ bn được s dng cho tách dòng
gen và ci cùng là các nguyên lý cùng k thut cơ bn trong phân tích
gen và h gen đã đưc gii thiu.
Phn năm (chương 12, 13, 14, 15) trình bày các nguyên cơ bn v
mã di truyn, cu trúc và biu hin ca gen, cũng như s điu hoà biêu
hin gen c sinh vt prokaryote và eukaryote. chương 15 ca phn này
cũng như chương 11 ca phn bổn, mt sô* khía cnh liên quan đên
phân tích h gen trong đó có h gen người - và s điu hoà hot đng
gen bi ARN, bao gm c s can thip ca ARN (AKN interference)
gii thưng Nobel 2006 - đã được cp nht.
Cun sách này là giáo trình thích hợp - tu mc độ s dng khác
nhau cho sinh viên, học viên cao học và nghiên cu sinh thuc ngành
sinh hc và công ngh sinh học c trưng đi hc KHTN, Sư phm, Y,
Dưc, ĐH Nông nghip, ĐH Lâm nghiệp,... đng thi cũng là tài liu hc
tp và tham kho ích cho học viên cao học, nghiên cu sinh các
trưng đi hc khác, các nhà khoa học chuyên ngành có liên quan các
Vin nghiên cu, hoc nhng ai quan tâm đến sinh học phân t.
Nhng phát kiến mới có liên quan đến sinh hc phân t đang xut
hin tng ngày và đy p thông tin. Trong khi đó, s hiu biết ca nhng
ngưi biên son cun sách này n hn hp. thế, trong sách hn n
nhng nhưc đim và thiếu sót. Kính mong đc gi đóng góp ý kiến. Moi ý
kiến đóng góp xin gửi v Công ty c phn Sách đi hc - Dy nghe
25 Hàn Thuyên, Hà Ni.
Xin chân thành cm ơn.
CÁC TÁC GI
8
Phn mt
CÁC LOI TÊ BÀO CÁC DI PHÂN T
CÁC LOI T BÀO
VÀ CÁC ĐI PHÂN T
1.1. PHÂN LOI T BÀO
1.1.1. Sinh vật nn sơ
Sinh vt nhân sơ (prokaryote) bao gồm ui khuân tht (eubacteria). vi
khun c (archaebacteria) và tảo lam (blue - green algae). Prokaryote
nhng tế bào sông đơn gin nht, thưng có đưng kính khong 1 - 1 0 .im
và được tìm thy mọi môi trưng ng, t trong rut đng vt cho đến
cho đến các sui c nóng axit. Các tê bào prokaryote được bao bc bi
màng tế o hay màng sinh cht (hình 1 .1) gm lp lipit kép gn kết vi
các phân t protcin bên trong cho phép các phân t kích thưc nh vào
và ra khi tế bào. Hu hêt các prokarxote có thành tế bào cng bên ngoài
màng bào tương, giúp tế bào không b phân hu trong nhng môi trưng
có tính thm thu thp. Phn trong tê bào (tế bào cht) có mt nhim
sc th mch vòng, kêt cht thành vùng nhăn (nucleoid), gn với màng
và thưng có các plasmit (các phân t ADN kích thưc nh mang lưng
thông tin di truyn hn chê), ARN, ribosome và hu hết các protein thc
hin các phn ng trao đôi cht ca tê bào. Mt protein gn vối màng
bào tương nhưng không có các bào quan chuyên bit như sinh vt
nhân tht (eukaryote).
Bổ mt tế bào có nhiu ng nhung cho phép chúng gn kết vi các
tế bào khác và các lông roi có thê chuyn đng quay vòng giúp cho các tế
bào bơi. Hu hết các prokaryote đơn bào. tuy nhiên cũng có mt s là
đa bào, trong đó mt sô tê bào nhât đnh thc hin các chc năng
chuyên hoá.
Chương
9
Lông nhung Thành tế bào
Hình 1.1. Sơ đ cu to ca tê bào prokaryote đin hình
Vi k h u n th á t và vi khun c khác nhau ch yêu m t hoá sinh.
H gen ca loài vi khun đơn gin nht, Mycoplasma genitalium chi có
580kb và mã hoá cho khong 470 protein. Nó có kh năng trao đôi cht
rt hn chế. Vi khun Escherichia coi có kích thưc h gen 4.600kb,
cha khong 4.200 gen kim soát việc tng hp khong 300 protein.
Vi k h u n c
Vi khuân cô thưng sông nhng môi trưng rt cực đoan, v mt
cu trúc, chúng giông VI vi khun tht. Tuy nhiên, trên cơ s tiên hoá
ca 1'ARN, chúng li khác bit vi các vi khun tht và khác c vi các
eukaryote khác. Chúng có nhng đc tính hoá sinh khác thưng, ví d,
chúng có các liên kết ete, hoc este trong lp màng lipit. H gen ca vi
khun cổ Methanococcus janaschii dài 1.740kb mã hoá cho ti đa 1.738
protein. Nhiu nghiên cu cho thy, vi khun c, các protein tham gia
vào quá trình sn sinh năng lưng và trao đổi cht giông với các vi
khun tht nhiu hơn. còn các protein tham gia vào các quá trình tái
bn, phiên mã và dch mã li giông vi các protein ca eukaryote nhiu
hơn. Điu đó chng tỏ rng, vi khun c và vi khun tht có cùnơ t tiên
chung mà không phi dng này tiên hoá t dng kia.
1.1.2. Sinh vật nhân thật
Sinh vt nhân tht eukaryote - được phân thành bôn giói là đng
vật, thc vật, nm và protista (tảo và nguyên sinh đng vt). Về cu
trúc, các eukaryote có các bào quan được bao bọc trong màng (hình 1 2 )
thc hin các chc năng trao đổi cht chuyên hoá. Tê bào eukarxote
thưng lớn hơn tế bào prokaryote: đưng kính khong 10 - 100um Tế
bào được bao bọc bỏi màng bào tương có hình dng cun xoăn cao đ làm
tăng din tích b mt. Thc vt, nhiu nm và protista cũng có thành tế
10
b-ào cng. Tế bào chât có dng gel đưc t chc cao, cha các bào quan và
ribosome. Ngoài ra, s sp xếp ca c si protein thành b khung ca
tê bào giúp kim soát hình dng và s vn đng ca tê bào cũng như tô
chc thc hin nhiu chức năng trao đi cht. Các sợi này, bao gồm các
vi ng được cu to t tubulin và c vi si được cu to t actin. Phn
lớn sinh vt eukaryote đa bào vi c nhóm tê bào đưc bit hoá trong
quá trình phát trin cơ th để to nên các mô chuyên hoá trong cơ thê.
Vi th
Hinh 1.2. đ cu to tế bào eukaryote đin hình
1.1.3. Sự biệt h
Khi tế bào phân chia, các tê bào con có th hoàn toàn giông nhau
hoc chúng có thê thay đôi phương thc biu hin gen đ tr nên khác
bit v chc năng so với tế bào mẹ.
Trong s sinh vt prokaryote và eukaryote bc thp, s hình thành
bào t là ví d vê kiêu biệt hoá tê bào như vy. Trong các eukaryote
đa bào phc tp. các tế bào phôi bit hoá thành các tế bào chuyên hoá
cao, ví d các tế bào cơ. thn kinh, gan, hoc thn. Trong hu hết các
trưng hp trên, hàm lưng ADN không đổi nhưng có s thay đổi các
11
gen đc phiên mã. S bit hoá được điểu hoà bi các gen kiêm soát Qua
trình phát trin. Đt biến các gen này sinh ra các cơ thê không bình
thưng, ví d chân mc v trí ca anten rui gim Drosophila. Việc
nghiên cu các gen như vy cho phép tìm hiu quá trình phát trin phôi,
ơ các eukaryote đa bào. s điu phối hot đn" ca các mô và các cơ
quan khác nhau đưc kiêm soát bng dòng thông tin gia chúng. Thông
tin đó bao gm các phân t tín hiu, như các cht dn truyn thn kinh
và các tác nhân sinh trưng, do mt mô tiết ra và tác đng đèn mô khác
thông qua th quan đc hiu trên b mt tế o.
1.2. CÁC BÀO QUAN
1.2ẵ1. Nhân tế bào
Xhân ca tế bào eukaryote mang thông tin di truyn trong các
nhim sc th. mi nhim sác th cha mt phân t ADX. Xhân được
bao bc bơi lp m àng kép lipit, màng nhân cha các l màng, cho phép
các phân t có kích thưc tương đôi lớn đi qua. S phiên mã xy ra trong
nhán và phân t ARN đã được sa đối đi ra tế bào cht, nơi din ra quá
trình dch mã.
N hân con hay hch nhăn nm trong nhân, là i rARX
được tng hp đê hình thành mt phn các ribosome.
1.2.2. Ty th và lc lp
Ty thê: S hô hp tế bào, nghĩa là s oxy hoá các cht dinh dưng
đ sinh ra năng lưng dng adenosine 5 - triphosphate (ATP), xy ra
ty th. Bào quan này có đưng kính khong 1 - 2(.im và có th có tới
10 0 0 - 2 0 0 0 ty th trong mt tế bào. Các ty th có m àng ngoài n hn và
màng trong gp nếp. to nên nhng mu li đưc gọi là răng lược. Ty
th cha ADX mch vòng có kích thưc nh. ARN đc hiu ca ty th
và các ribosome đ tng hp mt s' protein ty th. Tuy nhiên, phn lớn
protein ty thê đưc mã hoá bởi ADX nhân và đưc tng hp 0 tế bào
cht. Xhung protein này có đon trình t tín hiu đc hiu dn chúng
đi vào ty th.
L p thê ò thc vt i din ra quá trình quang hp - s đnơ
hoá nh ánh sáng. C 0 2 và c đ to ra carbohydrat và oxy. Mc dù I3 n
hơn ty th nhùng chúng cng có cu trúc ging ty th. ngoi tr môt
đếm là. vị trí các c, chúng có h thông m àng th ba (màng
thylakoid). Lớp màng này cha chlorophyll có kh năng by nãncr lơnơ
ánh sáng đ quang hp. v m t di truyn, lp th cũng đc môt
phn so vi nhân. Đã có nhiu giả thuyết cho rng, c ty thù ln '.p th
12
đêu sn phm ca quá trình tiên hoá t các prokaryote sông cng sinh
vi các eukaryote nguyên thu qua mt quá trình lịch s lâu dài.
1.2.3. Lưi ni chât
Lưi nội cht là h thông màng tế bào mở rng vào bôn trong tê bào
cht và ni vi màng nhân. Có th thy hai dng lưới nội cht hu hêt
các tê bào.
Lưi ni cht nhn mang nhiu enzym gn vi màng, kê c
các enzym tham gia vào quá trình sinh tng hp các lipit nht đnh và
vào quá trình oxv hoá và kh đc c hp eht ngoi lai như các thuôc
cha bnh.
Lưi ni cht xù xi cha nhiu ribosome. Các 1ibosomc này
chuyên tng hp các protein đ tế bào tiết ra, như các protein bào tương
hay protein sa, hay các protein sẽ được đa đên màng sinh cht hay
màng ca các bào quan nht đnh. Ngoài các protein màng sinh cht mà
lúc đu liên kết vi màng lưi nội cht ht, các protein này được chuyên
vào khoang trong ca i, nơi chúng được sa đôi. thưng là bng quá
trình đưng hoá. Lipit và protein tng hợp trên ới được các nang vn
chuyn chuyên hoá đa đcn phc hệ Golgi - chng các túi dt có màng
bao bọc - đ sa đổi tiếp, phân loại và gửi chúng đến nhng đa đim
cuối cùng cn đến.
1.2.4. Các vi thê
Lsosom e là các bào quan nh. có màng bao bọc, đưc to ra bng
cách mọc chi ri tách ra t phc h Golgi và cha nhiu loi enzym tiêu
hoá có khá năng phân hu protein, axit nucleic, lipit và carbohydrat.
Chúng hot đng như các trung tâm tái to các đi phân t ly t ngoài
vào tế bào và t các bào quan b tn thương. Mt sô" phn ng trao đổi
cht sinh ra các gc t do hot đng mnh và peroxide hydro ch xy ra
hn chế trong các bào quan có tên gi là peroxisome đ ngăn cn chúng
phá hu các thành phn ca tê o. Peroxisome cha enzym catalase
phân huv peroxide hydro:
2H A -> 2HO + 0 2
G lyoxysom e là các peroxisome thc vt chuyên hoá thc hin các
phn ng ca chu trình glycoxyl hóa. Lysosome, peroxisome và glyoxysome
được gi các vi thè.
1.2.5. ch các bào quan
Màng sinh cht ca các tê bào eukaryote có th b phá hu bi sc
thm thu kiếm soát s biên dng cơ hc, hoc các cht ty ra không lon
13
nht đnh. Các bào quan kích thưc lốn và khác bit v mt đ. như
nhân và ty th, có th được tách khi nhau và tách khi các bào quan
khác bng cách ly tăm da vào h slng ca chúng. Dch nghiến tê bào
được ly tâm vi tốc đ đ lốn đ m láng các bào quan nng nhát,
thưng là nhân. Sau đó, tách phn dịch bên trên cha các bào quan
khác đem ly tâm vi tốc độ đ đ làm lng các ty th, và cứ tiêp tc như
vy (hình 1.3a). K thut này cũng đưc s dng đ tách các phân đon
cha các loi tế bào có kích thưc khác nhau, ví d các tế bào hông câu,
bch cu và các tiu huyết cu trong máu. Mu thô gm các tê o,
nhân và ty th này cn được tiếp tc làm sch bng phương pháp ly tàm
gradient nng độ. K thut này cũng còn đưc dùng đê tách các bào
quan có mt đgiông nhau. Trong k thut ly tâm phăn l ng theo tốc độ
lng, hn hp được sp xếp thành lp, chng lên nhau do gradient nng
đ đnh sn ca dung môi s dng. Các băng (hay các vùng) cha các
thành phn khác nhau lng xung vi tốc đ khác nhau ph thuc vào
h s lng ca chúng và tách nhau ra (hình 1.3b). Mc đích s dng
gradient nng độ ca dung môi là ngăn cn s hoà trn đôi lưu ca các
thành phn sau khi đã tách ra và đm bo tốc độ lng tuyến tính ca
các thành phn (nó bù gia tốc cho các thành phn khi chúng lng tiêp
xung phía dưi ông nghim). Trong k thut ly tâm cân băng, gradient
nng đ mở rng tới m t đ. cao hơn m t đ ca mt, hoc nhiu thành
phn ca hn hp đ cho các thành phn đó tiến đến trng thái cân
bng ti đim bng vi mt đ riêng ca chúng và dng li. Trong
trưng hp này, gradient nng đ có th được xác đnh trưc và hn hợp
xếp thành lp bên trên, hoc t đnh hình, trong đó mu hoà trn với vt
cht gradient (hình 1.3c). Gradient nng đ được to thành t các cht
như sucrose, ficoll (polysaccant tng hợp), hoc chloride cesium (CsCl) để
tách axit nucleic. Tính tinh khiết ca các phân đon i tế bào có th
được c đnh bng kính hin vi đin tử, hoc đánh giá hot tính enzym
liên kết đc hiu VI bào quan đó. ví d succinate dehydrogenase tv thê
-
T hà nh p há n chuyn
1
T h ành phâ n chuy n
_
U
V
V à t đ
o
s
í n g ƠI m đn g châm nhát
o
V * .
:^p n n ĩ
. °
*. *
r *
. °
- ^
T ha nh p hàn chuyên
s r a
T h a m phá n chuyn
,
W
đòn g nh a nh
____
*
'< 3
đn g rvhanh nhát
ay 0,
Hinh 1.3. K thut ly tâm
a) Ly tâm ch; b) Ly tâm phản ng theo tốc độ lng; c) Ly m cn bp.g
14
1ế3. CÁC ĐI PHÂN T
1ế3.1. Protein và axit nucleic
Protem là các polvme gồm c axit amin liên kêt vi nhau bi liên kêt
peptit. Protein có c vai trò về cu trúc và chc năng. Các axit nucleic.
ADN và ARN, là các polyme gồm c nucleotit. Mỗi nucleotit được cu to
t mt bazơ nitơ. dưng pentose và axit phosphoric. Các axit nucleic làm
nhim v bo qun và truyn thông tin di truyn. Tuy nhiên, s biếu hin
ca thông tin di truyn cn có s tham gia ca protein.
1.3.2. Các polysaccarit
Các polysaccarit là các polvme gồm các đưng đơn liên kêt đng hoá
tr bng liên kết glvcosit. Chc năng ca chúng ch yếu là d tr đưng
dinh dưng và là các vt liu cu trúc.
Celulose (hình 1.4a) và tinh bt
thành phn chiếm s lưng lớn thc vt. Chúng đu là các polyme
nhúng khác nhau v phương thc liên kết các monome glucose vi nhau.
Cellulose là polyme mch thng vi các liên kết p
(1 - 4) (hình 1.4a) và
thành phn cu to chính ca thành tế bào thc vt. Có khong 40
chui và tm liên kết vi nhau bng liên kết hydro đ to thành sợi dai,
không tan trong nước. Tinh bt ngun d tr đưng và đưc tìm thv
dng các ht bên trong tế bào, c ht này có thê nhanh chóng b thu
phân đ gii phóng glucose cho quá trình trao đổi cht. Ht tinh bt
cha hai thành phn: a - amylose - polyme mch thng với các liên
kết a (1 - 4) và amylopectin - polyme phân nhánh với các liên kết ph
a (1 6). Cha tới 10G gôc glucose, các amylopectin là mt trong s
nhng phân t lớn nht đã được bt. Nhng kiu liên kết khác nhau
tinh bt to nên cu hình vn xon không th xếp cht lại đưc nên tinh
bột tan trong nước. Nm và mt sô mô động vt (như gan và cơ) d tr
glueose dưi dng glycogen - polyme phân nhánh gng như amylopectin).
Chitin được tìm thy thành bào nm và b xương ngoài ca côn
trùng và loài giáp xác. Nó gng vi cellulose nhưng các monome ca
là N - acetylglucosamine. Mucopolysaccarit (glycosaminoglyean) to nên
dưng dch giông như keo trong đó có đính xen k các protein dng si
ca mô liên kêt. Việc c đnh cu trúc ca các polysaccarit lớn khá
phc tp vì chúng không đng nht v thành phn và kích thưc, và vì
không th nghiên cu được chúng v mt di truyn hc như các axit
nucleic và protein.
15
HO,
6ÇH2OH
6c h 2oh
6ç h 2oh
H
- o
OH
JT
H
OH
H OH H OH
Glucose n Glucose
a)
- O H
H
OH
J S L0'
H
OH
6CH2OH
- O h
H
OH
J
o
X
H
OH
Glucose
Glucose
b)
Hinh 1.4. a) cu trúc ca cellulose vi các liên kết ß (1-> 4); b) Tinh bt u - amylose vi các
liên kết « (1-> 4); Các nguyên t carbon 1, 4 6 đưc đánh dấu. Các liên kết phu u (1-> 6)
tạo nên các nhánh amylopectin glycogen.
1.3.3. Lipit
Tng phân t lipit c th không tht s là đi phân t nhưng nhiu
phân t lipit được cu to t các đơn phân nh hơn và tham gia vào s
cu thành các đi phân t. Các phân t lipit ln ch yêu là các
hydrocarbon trong t nhiên và ít tan trong nước. Mt
s tham gia vào d
tr và vn chuyn năng lưng trong khi mt số khác là nhng thành
phn cơ bn cu thành màng, v bo vệ và các cu trúc tế bào khác.
Glycerit có mt, hai, hoc ba chui dài các axit béo este hoá với phân tử
glycerol, các triglycerit đng vt, các axit béo không có các liên kết đôi
(no) nên có chui thng, phân t có th bao gói cht và cht béo dng
rn. Du thc vt cha các axit béo không no vi mt, hoc nhiu liên
kết đôi. Cu trúc có góc cnh ca các chui này cn tr vic bao gói cht
nên chúng có xu thế dng lng nhit độ phòng. M àng tế bào có cha
các phospholipit đưc cu to
t glycerol este hoá vi hai Axt
axit béo và axit phosphoric. II ^
Phosphate cũng thưng bị
este hoá thành nhng phân t Glycero1
nh như serine, ethanolamine,
inositol, hoc choline (hình
1.5). M àng tế bào cũng cha
các sphingoỉipit như ceramit.
trong đó chui amino alcohol
sphingosine có mt axit o
liên kết bng liên kêt amit. S
gn kết ca phosphochlorine
vi ceramit sinh ra sphingomyelin.
H2Co C (CH2)7CH =CH(CH2)7CH2
. HC—o c (CH2)15CH3
I I X
H2 <~1 r X
0
1
Axit stearic
o p o CH2CH2N(C
\
\
o
Axit phosphoric
ChcLr
Hình 1.5. P h osph o lipit điến hinh'
pho sp hatidylch o line cha các axit stearic
và oleic este hoá
16
1.3.4. Các đi pn t phc
Nhiu đi phân t cha hơn mt loại đi phân t sinh học liên kêt
VI nhau theo kiu cộng hoá tr, hoc không cng hoá tr. Điu đó làm
tăng đáng k kh năng hot đng chức năng hoc cu trúc ca phc hệ.
d, hu hết các enzym đu protein, nhưng mt enzym có ARN
đóng vai trò quan trng đi vi hot tính xúc tác gn vào bng liên kết
không cng hoá tr. S kết hợp axit nucleic và protein to nên
nucleoprotein.
Ví d như telomerase, enzym chu trách nhim tái bn
các đu m út ca các nhim sc th eukaryote và ribonuclease p, enzym
hoàn thin ARN vn chuyn (tARN). telomerase, ARN hot đng
giông như chiếc khuôn đ tng hợp đon cui ca ADN, trong khi
ribonuclease. ARN cha vtrí xúc tác ca enzym. Ribonuclease p mt
ví d v ribozyme.
G lycoprotein cha c protein và carbohydrat (chiếm khong < 1%
đến > 90% khôi lượng); glycosit hoá dng ph biến nht ca các
protein đã được sa đổi sau dịch mã. Carbohydrat luôn liên kết cng hoá
tr vi b mt ca protein, mà không
liên kết bên trong protein và thưng
có cu trúc biến đng, to nên tính
không đng nht mc đ nh (hình
1.6). Điu đó làm cho việc nghiên cu
các glycoprotein tr nên khó khăn.
Các glycoprotein có chc năng m
rng ph hot tính ca các protein và
thưng đưc tìm thy ngoi bào.
Chúng là thành phn quan trng ca
màng tế bào và giúp các tê bào nhn
biết nhau.
P roteog lycan các phc h protein và mucopolysaccarit lớn (>107
Da), được tìm thy thành tê bào vi khun và khong không gian ngoi
bào ca các mô liên kêt. Các đơn v đưòng ca chúng thưng có nhóm
sulfate làm cho chúng có tính hydrat hoá cao. Hin tưng đó cng vi độ
dài ca chúng
(> 1 00 0 đơn v) làm cho dung dch có độ nht cao.
Proteoglycan hot dng như các cht bôi trơn và cht tiếp nhn nhng
thay đổi trong khong không gian ngoi o.
Các phân tư protein liên kết lipit có cha lipit liên kết cng hoá
Protein Carbohydrate
Hình 1.6. Câu trúc ca glycoprotein.
Nhng biu tưng khác nhau th hin
các đơn v m o n osaccarit khác nhau (ví
d galactose, N - acety lglu cosa m in e)
17
tr. Thành phn lipit thưng acyl béo (như myristoyl hoc palmitoyl),
hoc nhóm isoprenoid (như farnesyl hoc geranylgeranyl). Các nhóm
này hot đng như nhng chiếc mneo cm protein vào màng thông qua
tương tác k nưc VI lipit trên màng và tăng cưng liên kết protein -
protein.
Trong các phân t lipoprotein, lipit và protein liên kết không cng
hoá tr. Vì lipit ít tan trong c nên chúnp đưc vn chuyn trong máu
dưới dng lipoprotein. Các lipoprotein cơ bn là các ht triglycerit và
este cholesterol, được bao bọc bi lp v phospholipit, cholesterol và
protein (apolipoprotein). Các apolipoprotein có cu trúc đ các axit amin
k nưc ca chúng hưng vào các lipit bên trong ht, trong khi các axit
amin phân cực và tích đin hưng ra bên ngoài môi trưng. Điêu đó làm
cho các ht này tan đưc trong c.
Các g lyco lipit bao gm các cerebrosit và gangliosit có các thành
phn lipit và carbohydrat liên kết cng hoá tr. Chúng có mt nhiu
màng các tế bào não và thn kinh.
1.4 S TP HP CÁC ĐI PHÂN TỬ
1.4.1 Các phc h protein
Tê bào cha nhiu phc h lớn gồm
nhiu đi phân t cùng loi hoc khác loại.
Nhiu yếu tô" cu trúc hoc vn đng chính
ca .tế bào cha các phc h protein. B
khung xương ca tế bào là cách sp xếp các
si protein giúp đinh hình tế bào, giúp tế
bào vn đng và phân bố các bào quan
trong tế bào. Các ui ng là các polyme dài
gồm các protein tubulin, loi protein hình
cu khôi lưng phân t llOkDa (hình 1.7.)
Chúng là thành phn chính ca bộ khung
xương và ca lông nhung, lông roi - loại
cu trúc giông như si tóc trên bê' mt
nhiu tế bào, có kh năng đp làm cho tế
bào vn đng hoc đy cht lng chy qua
bề mt tế bào. Lông nhung còn cha c
protein nexin và dynein.
b)
300A
(30nm)
Hình 1.7. Sơ đõ cho thây (a)
mt ct ngang (b) cu
trúc b mt cua các tiếu đơn
v a và p trong các vi ng
18

Preview text:

LÊ DUY THÀNH (Chủ biên)
ĐỖ LÊ THẢNG - ĐINH ĐO ÀN LỌNG TRẦN THỊ HỒNG ^ 9
NHÀ XUẤT BẢN GIÁC DỤC
LÊ DUY THÀNH (Chủ biên)
Đ ỗ LÊ THĂN G - ĐINH ĐOÀN LONG - TR Â N THỊ HONG C ơ SỞ SINH HỌC PHÔN TỬ
(Tái bản lần thứ nhất)
NHÀ XUẤT BẢN GIÁO DUC
Công ty cổ phần sách Đại học - Dạy nghề - Nhà xuất bản Giáo dục giữ quyến công bố tác phẩm.
Mọi tổ chức, cá nhân muốn sử dụng tác phẩm dưới mọi hình thức phải đưoc sự đóng ý của
chủ sở hữu quyền tác giả.
04 - 2 0 0 9 /C X B /5 28 - 21 17/GD
M ã số : 7 K 7 8 4 \ 9 - D -\I MỤC LỤC LỜI n ó i đầu 3 Phần một
CÁC LOẠI TẾ BÀO VÀ CÁC ĐẠI PHÂN TỬ
Chương 1. Các loại tè bào và các đại phàn t ử ...........................................................9
1.1. Phân loại tế b à o ........................................................................................... 9
1.2. Các bào q u a n ............................................................................................. 12
1.3. Các đại phàn tử.......................................................................................... 15
1.4. Sự tập hợp các đại phân tử....................................................................... 18 Phần hai
CẤU TRÚC, CHỨC NĂNG VÀ PHƯƠNG PHÁP PHÂN TÍCH PROTEIN
Chương 2. Cấu trúc, chức nàng và phưong pháp phân tích p r o t e i n ............ 21
2.1. Axit a m i n ................................................................................................... 22
2.2. Cấu trúc và chức năng của protein......................................................... 24
2.3. Phân tích protein....................................................................................... 31 Phần ba
CẤU TRÚC VÀ ĐỘNG THÁI CỦA ADN
Chương 3. Axit deoxyribonucleic ( A D N ) ................................................................ 35
3.1. Mô hình cấu trúc ADN cùa Watson và Crick....................................... 36
3.2. Thành phần hoá học của A D N ................................................................ 41
3.3. Cấu trúc của A D N ..................................................................................... 42
3.4. Một sô' đặc điểm vật lý của A D N ............................................................46
3.5. Chức năng sinh học của A D N ................................................................. 49
3.6. Khái niệm về g e n ...................................................................................... 50
Clìươiìg 4. Tái bản cùa A D N ........................................................................................ 52
4.1. Các mô hình tái bản ADN: bảo toàn, bán bảo toàn và phàn tán........53
4.2. Các thành phần cần thiết cho sự tái bản ADN ở pro ka ry o te ............. 58
4.3. Tái bản ADN sợi kép à prokaryote.......................................... 66 3
4.4. Tái bản ADN ở eukaryote....................................................................... 73
4.5. Tính chính xác của quá trình tái b ả n ......................................................74
Chương 5. Tái bản của các loại axit nucleic k h á c ................................................ 7
5.1. Cơ chế tái bản adn mạch đơn của phage 0 X 1 7 4 .................................. 77
5.2. Tổng hợp ARN mạch đơn ở virut khảm thuốc l á .................................82
5.3. ARN làm khuôn cho việc tổng hợp ADN ở Retrovirut - H I V .......... 84
5.4. Phage lambcla và hiện tượng tiềm t a n .................................................... ^
Chương 6. Đột biến và sửa chữa A D N ..................................................................... 95
6.1. Khái niệm về đột b iế n .............................................................................. 96
6.2. Các cơ chế đột b iế n ................................................................................... 96
6.3. Tần số đột b iế n .........................................................................................102
6.4. Phân lập đột b iế n ..................................................................................... 103
6.5. Các đột biến thầm lặng........................................................................... 105
6 .6 . Các tác nhân gây đột b iế n ...................................................................... 106
6.7. Những hậu quả của quá trình đột b iế n ................................................. 111
6 .8 . Sửa chữa A D N .......................................................................................... 114
Chương 7. Bản chất của g e n ....................................................................................... 122
7.1. Định nghĩa về g e n ....................................................................................122
7.2. Kích thước của gen.................................................................................. 123
7.3. Nghịch lý của giá trị c ............................................................................124
7.4. Thông tin trong g e n ................................................................................. 125
7.5. Gen cấu tr ú c .............................................................................................. 126
7.6. Các yếu tố điều h o à ................................................................................. 130
7.7. Gen mã hoá các protein và A R N ........................................................... 132 P h ần bốn
KỸ THUẬT THAO TÁC TRÊN ADN
ClìUơng 8. Kỹ thuật P C R ............................................................................................. 1 3 4
8.1. Các giai đoạn của P C R ............................................................................ 134
8.2. Các điều kiện của phản úna P C R .......................................................... 139
8.3. Các ADN polymerase chịu nhiệt........................................................... 142
8.4. ADN k h u ô n ...............................................................................................143
8.5. Mồi oligonucleotit................................................................................... 144
8 .6 . Ghép đôi sai của m ồ i............................................................................... Ị45
8.7. PCR trong việc chẩn đoán bệnh di truyền................................... ......147
8 .8 . Tách dòng các sán phẩm PCR............................................................... 150 4
8.9. R T - P C R ................................................................................................ 151
8 . 10. R e a l- t im e PCR................................................................................... 152
Chương 9. Các vectơ tách d ò n g ...............................................................................
9 . 1. Thiết kế các vectơ plasmit..................................................................... 154
9.3. Cosmit và nhiễm sắc thể nấm men nhân t ạ o ...................................... 163
9.4. Các vectơ cho sinh vật eukaryote......................................................... 167
Chương 10. Tách dòng g e n .........................................................................................172
10.1. Xây dựng thư viện hệ gen.................................................................... 173
10.2. Xây dựng thu viện cADN (cDNA library)....................................... 179
10.3. Tách dòng cADN theo chiểu xác đ ịn h .............................................. 183
10.4. Xây dựng thư viện gen dựa trên P C R ................................................ 185
10.5. Xây dựng thư viện giản lược...............................................................187
10.6. Xây dựng thư viện gen sau dự án giải mã hộ g e n ............................ 190
Chương 11. Phân tích gen và hệ g e n ............................ ......................................... 191
11.1. Các gen trong hộ gen............................................................................191
11.2. Giai trình tự bazơ nitơ trong ADN...................................................... 194
11.3. Giải mã trình tự hệ gen.........................................................................205
11.4. Dự án hộ gen ng ư ờ i.............................................................................. 207
11.5. Tìm và xác định vị trí g e n ................................................................... 215
11.6. Xác định vai trò và chức năng g e n .....................................................216
11.7. Tin sinh học............................................................................................218 P h ần nãm
MÃ DI TRUYỀN - BIỂU HIỆN CỦA GEN
VÀ ĐIỀU HOÀ S ự BIỂU HIỆN CỦA GEN
Chương 12. Mã di t r u y ề n ............................................................................................220
12.1. Mã di truyền có tính thoái h o á ........................................................... 220
12.2. Ba nguyên tắc điều khiến mã di truyền............................................. 229
12.3. Đột biến ức chế có thể nằm trong cùng gen, hoặc khác g e n .........231
12.4. Tính vạn năng của mã di truyền......................................................... 234
Chương 13. Biêu hiện gen ờ sinh vậí p r o k a ry o te .................................................237
13.1. Môi liên hệ giữa ADN, ARN và p rotein........................................... 238
13.2. Protein/polypeptit và hoạt tính sinh h ọ c ........................... : ............... 239
13.3. Nhu cầu năng lượng trong quá trình tổng họp p ro te in ................... 242
13.4. Các thành phần tham gia tổng hợp protein........................................243
13.5. Quá trình tổng họp protein.................................................................. 253
13.6. Phiên m ã .................................... 255
13.7. Dịch m ã ............................... 261
13.8. Sự cuộn xoắn của protein..... ...266
Chương 14. Điêu hoà biêu hiện gen ở sinh vật p r o k a r y o te .............................. 268
14.1. Điều hoà trao đổi c h ất............ ....................... 269
14.2. Điều hoà hoạt động của tế bào...............
........................... 270
14.3. Các Operon lac, trp, ara.......................................................................274
Chương 15. Cấu trúc và biểu hiện của gen ử sinh vật e u k a r y o te ..................299
15.1. ADN và nhiễm sắc thể ở sinh vật eukaryote.................................... 299
15.2. Protein histon và protein phi histon.................................................... 303
15.3. Sự đóng gói của A D N .......................................................................... 304
15.4. Gen ở sinh vật eukaryote...................................................................... 306
15.5. Hiện tượng methyl hoá các gen ........................................................... 309
15.6. Các enzym ARN polymerase I, II và III.............................................311
15.7. Quá trình cắt nối của A RN................................................................... 313
15.8. Những biến đổi sau phiên mã của A R N .............................................321
15.9. Điều hoà hoạt động gen bởi protein................................................... 323
15.10. Điều hoà hoạt động gen bởi A R N .....................................................325
Tài liệu tham k h ả o ................................................................................................... 3 3 1 6
T ro n g k h o ả n g 3 t h ậ p kỷ qua, c hú ng ta đã t r ả i q u a m ột cuộc cách
m ạ n g k iê n th ứ c về n h ữ n g v â n đề liên q u a n đế n các q u á t r ì n h lư u trữ ,
tr u y ề n đ ạ t và b iể u h iệ n của th ô n g tin di tr u y ề n ở mức độ p h â n tử.
Các k iê n th ứ c c ủa sin h học p h â n tử cho p h é p c h ú n g ta giải th íc h
được môi q u a n h ệ g iữa cấu trú c và chức n ă n g c ủ a các p h â n tử s in h học
cũng n h ư sự v ậ n h à n h và kiểm soát các qu á t r ì n h ho á s in h tro n g t ế bào.
T â m đ iế m c ủ a s in h học p h â n tử là việc n g h iê n cứu các đại p h â n tử và
các phức h ệ đ ạ i p h â n tử của ADN, ARN và p ro te in cù n g các q u á t r ì n h
tá i b ản , p h iê n m ã và dịch mã.
T ro n g s ố các tiế n bộ kỹ t h u ậ t góp p h ầ n tạ o r a cuộc b ù n g n ổ về k iế n
th ứ c nói tr ê n , th ì trước tiê n p h ả i kể đến n h ữ n g t h à n h tự u c ủ a kỹ t h u ậ t
di t r u y ề n h a y th a o tác gen. n h ằ m tạo r a các p h â n tử A D N tá i tổ hợp đề
có th ê ứ n g d ụ n g tro n g lĩnh vực c h uy ển gen. Nó k h ô n g chỉ góp p h ầ n củ n g
cô các k iế n th ứ c cơ b ả n m à còn được áp d ụ n g để tạ o r a các s in h v ậ t
c h u y ê n gen. s ả n x u ấ t r a các s ả n p h ẩ m a n to à n sử d ụ n g tr o n g y học, thự c
p h ẩ m , c h ẩ n đ o á n các b ệ n h di tr u y ề n và liệu p h á p gen ở người. Đ iểu nà y
k h iế n cho m ộ t s ố q u a n niệm v ẫ n còn ngự trị cách đ â y k h ô n g lâ u của
c h ú n g t a về k h ả n ă n g ứ n g d ụ n g các t h à n h tự u c ủ a s in h học p h â n tử vào
th ự c tiễn, đ ã t h a y đổi. C h ẳ n g h ạ n . vào th ậ p kỷ 70 c ủa t h ế kỷ XX, việc đề
x u ấ t r a ý tư ở n g p h â n lập gen h a y sử d ụ n g liệu p h á p ge n để c h ữ a ch ạy
các b ệ n h n a n y cho con người được coi là v iển vông, th ì n g à v n a y nó đ a n g
h iệ n h ữ u , hoặc đ a n g d ầ n trỏ t h à n h h iệ n thực. T heo dự bá o c ủ a Viện
n g h iê n cứu quốc gia Mỹ về gen người ttyì. đến k h o ả n g n ă m 2010. người
t a sẽ tìm r a các k h iê m k h u v ê t gen ở mọt sô b ệ n h h iể m n g h è o n h ư u n g
thư . đột quỵ. P a r k in s o n . A n z h eim e r, AID S,... và d ù n g liệ u p h á p gen để
đ iề u trị. Đ ế n n ă m 2 0 l õ sẽ mở rộ n g phương p h á p điề u t r ị v à sử d ụ n g liệu
p h á p gen d ự a th e o b ả n đồ gen của b ệ n h n h â n . T ừ s a u n ă m 2025 sẽ điề u
c h ỉn h các k h u y ế t t ậ t di tr u y ề n ở người bằn g liệu p h á p gen.
Nội d u n g c u a cuốn sách n à y đã được lựa chọn để p h ả n á n h n h ữ n g
t h à n h tự u lý t h u y ế t cũ n g n h ư n h ữ n g kỹ t h u ậ t cơ b ả n áp d ụ n g vào việc
p h â n tích các q u á t r ì n h s in h học ỏ mức độ p h â n tử. I
C uôn s á c h có 15 chương thuộc 5 phần chính n h ư sau:
— P h â n m ộ t (chương 1) giới thiệu vê các loại tê bào p r o k a ơ ° ^ e’
eukaryote và các đ ạ i p h â n tử.
— P h ầ n h a i (chương 2 ) đề cập đến cấu trúc, chức n ă n g c ú a p ro te in và
phươ ng p h á p p h â n tích chúng.
— P h ầ n b a (chương 3, 4, 5, 6 , 7) thảo lu ậ n về cấu trú c v à độn g t h á i
củ a A D N tro n g q u á t r ì n h h o ạ t động. Ngoài ra, b ả n c h ấ t c ủ a gen cũ n g
được đề cập đ ế n ở đây.
— P h ầ n bôn (chương 8 , 9, 10, 11) trìn h b à y các n g u y ê n lý vê m ặ t lý
th u y ế t và n g u y ê n tắc c ủ a các kỹ t h u ậ t cơ b ả n tro n g th a o tác A D N . ơ đây,
kỹ t h u ậ t PCR, m ộ t sô" loại vectơ tá c h dòng d ù n g cho sinh v ậ t p r o ka ry o te
cũ n g n h ư e u k a r y o te , các phương p h á p cơ b ả n được sử dụ n g cho tá c h dòng
gen v à cuôi c ù n g là các n g uy ên lý cùng kỹ t h u ậ t cơ b ả n tro n g p h â n tích
gen và h ệ gen đ ã được giới thiệu.
— P h ầ n n ă m (chương 12, 13, 14, 15) tr ì n h bày các n g u y ê n lý cơ b ả n về
m ã di tru y ề n , c ấ u tr ú c và biểu h iện của gen, c ũ n g n h ư sự đ iề u h o à b iê u
h iệ n gen ở cả s in h v ậ t p roka ryo te eukaryote. Ớ chương 15 c ủ a p h ầ n n à y
cũng n h ư ở chương 11 của p h ầ n bổn, một sô* k h ía c ạ n h liên q u a n đ ê n
p h â n tích h ệ gen — tro n g đó có hệ gen người - và sự điề u h o à h o ạ t động
gen bởi ARN, bao gồm cả sự can thiệp của ARN (AKN — in te rfe re n c e ) —
giải th ư ở n g Nobel 2006 - đã được cập n h ậ t.
C uổn sác h n à y là giáo t r ì n h thích hợp - tu ỳ mức độ s ử d ụ n g k h á c
n h a u — cho s in h viên, học viên cao học và n g h iê n cứu s in h th u ộ c n g à n h
sin h học v à công n g h ệ s in h học ở các trư ờ ng đại học K H T N , S ư p h ạ m , Y,
Dược, Đ H N ô n g ngh iệp, Đ H L â m nghiệp,... đồng thời c ũ n g là tà i liệ u học
tậ p và t h a m k h ả o bô ích cho học viên cao học, n g h iê n c ứ u s in h ở các
trư ờ n g đ ạ i học kh ác, các n h à k h o a học ch u y ên n g à n h có liê n q u a n ở các
Viện n g h iê n cứu, hoặc n h ữ n g ai q u a n tâ m đến s in h học p h â n tử.
N h ữ n g p h á t k iế n mới có liên q u a n đến s in h học p h â n tử đ a n g x u ấ t
h iệ n từ n g n g à y v à đ ầ y ắ p th ô n g tin. T rong k h i đó, sự h iể u b iế t c ủ a n h ữ n g
người b iê n s o ạ n cuốn s á c h n à y còn h ạ n hẹp. Vì thế, tr o n g s á c h h ẳ n còn
n h ữ n g nhược đ iể m và th iế u sót. K ính m ong độc giả đóng góp ý k iế n . Moi ý
k iế n đóng góp x in gửi về Công ty c ổ p h ầ n S á c h đại học - D ạ y n g h e
25 H à n T h u y ê n , H à Nội.
Xin c h â n t h à n h c ảm ơn. CÁC TÁC GIẢ 8 Phần một
CÁC LOẠI TÊ BÀO VÀ CÁC DẠI PHÂN TỬ CÁC LOẠI TẾ BÀO Chương
VÀ CÁC ĐẠI PHÂN TỬ
1.1. PHÂN LOẠI T Ế BÀO
1.1.1. Sinh vật nhân sơ
S i n h v ậ t n h â n sơ (prokaryote) bao gồm ui k h u â n t h ậ t (e u b a c te r ia ). vi
k h u ẩ n cổ (archaebacteria)tảo la m (blue - green a lg ae). Prokaryote
n h ữ n g t ế bào sông đơn giản n h ấ t, thường có đường k ín h k h o ả n g 1 - 1 0 ị.im
và được tìm t h ấ y ở mọi môi trư ờng sông, từ tro n g r u ộ t động v ậ t cho đến
cho đ ế n các suố i nước nóng axit. Các tê bào p roka ryo te được bao bọc bởi
m à n g t ế bào h a y m à n g s in h chất (h ìn h 1 .1) gồm lớp lipit k é p gắ n k ế t với
các p h â n tử p ro tc in bê n tro n g cho phép các p h â n tử kích thước nhỏ vào
và r a khỏi t ế bào. H ầ u h ê t các prokarxote có t h à n h t ế bào c ứ n g b ê n n goài
m à n g bào tương, giúp t ế bào k hô n g bị p h â n h u ỷ tro n g n h ữ n g môi trư ờ n g
có tín h t h ẩ m t h ấ u th ấ p . P h ầ n tro n g tê bào (tế bào chất) có m ộ t n h iễ m
sắc th ể m ạ c h vòng, k ê t c h ặ t th à n h v ù n g n h ă n (nu cleo id), g ắ n với m à n g
v à th ư ờ n g có các p la s m it (các p h â n tử ADN kích thước n h ỏ m a n g lượng
th ô n g tin di t r u y ề n h ạ n chê), ARN, ribosome và h ầ u h ế t các p ro te in thực
h iệ n các p h ả n ứ n g tr a o đôi c h ấ t của tê bào. M ột sô p ro te in gắ n vối m à n g
bào tư ơ n g n h ư n g k h ô n g có các bào q u a n c h u y ê n b iệ t n h ư ở s in h vật
n h â n th ậ t (eukaryote).
Bổ m ặ t t ế bào có n h iề u lông n h u n g cho p h é p c h ú n g g ắ n k ế t với các
t ế bào k h á c và các lông roi có th ê chuyển động q u a y vòn g giú p cho các t ế
bào bơi. H ầ u h ế t các pro ka ry o te là đơn bào. tu y n h i ê n c ũ n g có m ột s ố là
đ a bào, tr o n g đó m ộ t sô tê bào n h â t đ ịn h th ự c h iệ n các chức n ă n g c h u y ê n hoá. 9 Lông nhung Thành tế bào
H ìn h 1.1. Sơ đồ cấu tạo của tê bào p ro k a ry o te điển hình
Vi k h u ẩ n t h á t và vi k h u ẩ n cổ k h á c n h a u c h ủ y ê u vê m ặ t h o á sin h.
H ệ gen c ủa loài vi k h u ẩ n đơn giản n h ấ t, M y c o p la s m a g e n i t a l i u m chi có
580kb và m ã h o á cho k h o ả n g 470 protein. Nó có k h ả n ă n g tr a o đôi c h ấ t
r ấ t h ạ n chế. Vi k h u ẩ n Esch erichia coỉi có kích thước h ệ ge n 4.600kb,
c h ứ a k h o ả n g 4.200 gen k iể m s o á t việc tổng hợp k h o ả n g 300 p ro te in . Vi k h u ẩ n c ố
Vi k h u â n cô th ư ờ n g sông ỏ n h ữ n g môi trư ờ n g r ấ t cực đ o a n , v ề m ặ t
c ấu trú c , c h ú n g giông VỚI vi k h u ẩ n th ậ t. T u y n h iê n , t r ê n cơ sở tiê n hoá
c ủa 1'ARN, c h ú n g lại k h á c b iệ t với các vi k h u ẩ n t h ậ t và k h á c cả với các
eukaryote k h á c . C h ú n g có n h ữ n g đặc tín h h o á s in h k h á c th ư ờ n g , ví dụ,
c h ú n g có các liê n k ế t ete, hoặc este tro n g lớp m à n g lipit. H ệ gen c ủ a vi
k h u ẩ n cổ M ethanococcus ja n a s c h i i dài 1.740kb m ã h o á cho tối đ a 1.738
p rotein. N h iề u n g h iê n cứu cho th ấy , ở vi k h u ẩ n cổ, các p r o te in t h a m gia
vào q u á t r ì n h s ả n s in h n ă n g lượng và tr a o đổi c h ấ t giông với các vi
k h u ẩ n t h ậ t n h iề u hơn. còn các p ro te in t h a m gia vào các q u á t r ì n h tái
bản , p h iê n m ã v à dịch m ã lại giông với các p r o te in c ủ a e u k a r y o te n h iề u
hơn. Đ iều đó c h ứ n g tỏ rằ n g , vi k h u ẩ n cổ v à vi k h u ẩ n t h ậ t có c ù n ơ tổ tiê n
c h u n g m à k h ô n g p h ả i d ạ n g n à y tiê n h o á từ d ạ n g kia.
1.1.2. Sinh vật nhân thật
S in h v ậ t n h â n t h ậ t — eukaryote - được p h â n t h à n h bôn giói là đ ộ n g
vật, thực vật, n ấ m p r o tis ta (tảo và n g u y ê n s in h độ ng vật). Về c ấ u
trú c , các e u ka ry o te có các bào q u a n được bao bọc tro n g m à n g ( h ìn h 1 2 )
th ự c h iệ n các chức n ă n g tra o đổi c h ấ t c h u y ê n hoá. Tê bào e u ka rx o te
th ư ờ n g lớn hơn t ế bào p rokaryote: đường k ín h k h o ả n g 10 - 1 0 0 um T ế
bào được bao bọc bỏi m à n g bào tương có h ìn h d ạ n g cuộn x o ăn cao để là m
t ă n g diện tích bề m ặ t. T hự c v ậ t, n h iề u n ấ m v à p r o ti s ta c ũ n g có t h à n h t ế 10
b-ào cứng. T ế bào c h â t có d ạng gel được tổ chức cao, c h ứ a các bào q u a n và
ribosome. N goài ra, sự sắp xếp của các sợi p ro te in t h à n h bộ k h u n g của
tê bào giúp k iể m so át h ình d ạ n g và sự vậ n động c ủ a tê bào c ũ n g n h ư tô
chức th ự c h iệ n n h iề u chức n ă n g tra o đổi chất. Các sợi này, bao gồm các
vi ống được c ấ u tạ o từ tu b u lin và các vi sợi được cấu tạ o từ actin. P h ầ n
lớn s in h v ậ t eu karyote là đa bào vối các n h ó m tê bào được biệt hoá tro n g
q u á t r ì n h p h á t t r i ể n cơ th ể để tạo n ê n các mô c h u y ê n h o á tro n g cơ thê. Vi thể
H in h 1.2. Sơ đồ cấu tạo tế bào eu k a ry o te điển hình 1.1.3. Sự biệt hoá
K hi t ế b à o p h â n chia, các tê bào con có th ể h o à n t o à n giông n h a u
hoặc c h ú n g có th ê t h a y đôi phư ơ n g thức biể u h iệ n gen để trở n ê n k h á c
b iệ t về chức n ă n g so với t ế bào mẹ.
T ro n g s ố s in h v ậ t p roka ryo teeukaryote bậc th ấ p , sự h ì n h t h à n h
bào tử là ví d ụ vê k iê u biệt hoá tê bào n h ư vậy. T ro n g sô các eu karyote
đa bào p h ứ c tạ p . các t ế bào phôi biệt hoá t h à n h các t ế bà o c h u y ê n hoá
cao, ví d ụ các t ế bào cơ. t h ầ n kinh , gan, hoặc th ậ n . T r o n g h ầ u h ế t các
tr ư ờ n g hợp tr ê n , h à m lượng ADN khôn g đổi n h ư n g có sự th a y đổi các 11
gen đứỢc p h iê n m ã. Sự b iệ t hoá được điểu hoà bởi các gen k iê m soát Qua
tr ì n h p h á t triể n . Đột b iế n các gen này s in h r a các cơ th ê k h ô n g bình
thường, ví dụ c h â n mọc vị t r í của a n te n ỏ ruồi giấm D r o s o p h ila . Việc
n g h iê n cứu các gen n h ư v ậ y cho phép tìm h iể u q u á t r ì n h p h á t tr i ể n phôi,
ơ các e u ka ry o te đ a bào. sự điều phối h o ạ t đ ộ n " c ủ a các mô và các cơ
q u a n k h á c n h a u được k iê m soát b ằ n g dòng th ô n g tin g iữ a c h ú n g . T h ô n g
tin đó bao gồm các p h â n tử tín hiệu , n h ư các c h ấ t d ẫ n t r u y ề n t h ầ n k in h
và các tác n h â n s in h trư ởng, do một mô tiế t r a v à tác động đ è n mô k h á c
th ô n g q u a t h ụ q u a n đặc h iệ u tr ê n bề m ặ t t ế bào. 1.2. CÁC BÀO Q UAN
1.2ẵ1. Nhân tế bào
X h â n c ủ a t ế bào eu karyote m a n g th ô n g tin di t r u y ề n t r o n g các
n h iễ m sắc th ể. mỗi n h iễ m sác th ể c h ứ a m ột p h â n tử ADX. X h â n được
bao bọc bơi lớp m à n g ké p lipit, m à n g n h â n c h ứ a các lỗ m à n g , cho p h ép
các p h â n tử có k íc h thước tư ơ n g đôi lớn đi qua. Sự p h iê n m ã x ả y r a tro n g
n h á n và p h â n tử A R N đ ã được sửa đối đi r a t ế bà o c h ấ t, nơi d iễ n r a q u á
t r ì n h dịch m ã. N h â n con h a y h ạ c h n h ă n n ằ m tr o n g n h â n , là nơi rA R X
được tố n g hợp đê h ì n h t h à n h m ột p h ầ n các ribosom e.
1.2.2. Ty thể và lục lạp
T y th ê : Sự hô h ấ p t ế bào, n g h ĩa là sự oxy h o á các c h ấ t d i n h d ư ỡ n g
để s in h r a n ă n g lượ ng ở d ạ n g a d e n o s in e 5’ - t r i p h o s p h a t e (ATP), x ả y r a
ty thể. Bào q u a n n à y có đườ ng k ín h k h o ả n g 1 - 2(.im v à có t h ể có tới
1 0 0 0 - 2 0 0 0 ty th ể tro n g m ột t ế bào. Các ty th ể có m à n g n g o à i n h ẫ n và
m à n g tr o n g g ấ p nếp . tạ o n ê n n h ữ n g m ấ u lồi được gọi là r ă n g lược. Ty
t h ể c h ứ a A D X m ạ c h vòn g có kíc h thước nhỏ. A R N đ ặc h iệ u c ủ a ty th ể
và các rib o s o m e để tổ n g hợp m ộ t số' p r o te in ty th ể . T u y n h iê n , p h ầ n lớn
p r o te in ty th ê được m ã h o á bởi ADX n h â n v à được tổ n g h ọ p 0 t ế bào
c h ấ t. X h u n g p r o te in n à y có đo ạ n tr ìn h tự tín h iệ u đặc h iệ u d ẫ n c h ú n g đi vào ty th ể .
L ạ p t h ê ò th ự c v ậ t là nơi diễn r a qu á t r ì n h q u a n g hợp - sự đồnơ
hoá nhờ á n h sán g. C 0 2 và nước để tạo r a c a r b o h y d r a t v à oxy. M ặc d ù I3 n
hơn ty th ể n h ù n g c h ú n g củ n g có c ấ u tr ú c giỏng ty th ể . n g oại t r ừ m ô t
địếm là. ở vị t r í các lược, c h ú n g có hệ th ô n g m à n g t h ứ b a (m à n g
th y la k o id ). Lớp m à n g n à y c h ứ a chlorophyll có k h ả n ă n g b ẫ y nãncr lừơnơ
á n h s á n g để q u a n g hợp. v ề m ặ t di tru y ề n , lạp th ể c ũ n g độc m ôt
p h ầ n so với n h â n . Đ ã có n h iề u giả th u y ế t cho rằ n g , cả ty thù lẫ n '.ạp th ể 12
đêu là s ả n p h ẩ m c ủa q uá trìn h tiê n hoá từ các pro ka ry o te sông cộng sinh
với các eu karyote n g u y ê n th u ỷ qua m ột q u á t r ì n h lịch sử lâ u dài.
1.2.3. Lưới nội chât
Lưới nội ch ấ t là hệ th ô n g m à n g t ế bào mở rộn g vào bôn tro n g tê bào
c h ấ t v à nối với m à n g n h â n . Có th ể th ấ y h a i d ạ n g lưới nội c h ấ t ở h ầ u h ê t
các tê bào. Lưới nội chất n h ẵ n m a n g n h iề u e nzym gắ n với m àng , kê cả
các e n zy m t h a m gia vào qu á tr ì n h sin h tổng hợp các lip it n h ấ t đ ịn h và
vào q u á tr ì n h oxv ho á và k h ử độc các hợp e h ấ t ngoại lai n h ư các thuôc
c h ữ a bệ n h . Lưới nội chất xù x i chứa n h iề u ribosom e. Các 1’ibosom c n à y
ch u y ê n tổ n g hợp các p ro te in đổ t ế bào tiế t ra, n h ư các p ro te in bào tương
h a y p ro te in sữa, h a y các p ro tein sẽ được đứ a đê n m à n g s in h c h ấ t hay
m à n g c ủ a các bào q u a n n h ấ t định. Ngoài các p ro te in m à n g s in h c h ấ t m à
lúc đ ầ u liên k ế t với m à n g lưới nội c h ấ t h ạ t, các p ro te in n à y được c h u y ên
vào k h o a n g tro n g c ủa lưới, nơi c h ú n g được s ử a đôi. th ư ờ n g là b ằ n g q u á
t r ì n h đườ ng hoá. L ip it và p ro te in tổng hợp t r ê n lưới được các n a n g vậ n
ch u y ển c h u y ê n ho á đứ a đ c n p h ứ c hệ Golgi - chồng các tú i d ẹ t có m à n g
bao bọc - để s ử a đổi tiếp, p h â n loại và gửi c h ú n g đ ế n n h ữ n g đ ịa điểm
cuối c ù n g c ầ n đến. 1.2.4. Các vi thê
L ỵ s o s o m e là các bào q u a n nhỏ. có m à n g bao bọc, được tạ o r a b ằ n g
cách mọc chồi rồi tá c h r a từ phức hệ Golgi và chứ a n h iề u loại e n z y m tiêu
hoá có k h á n ă n g p h â n h u ỷ protein, axit nucleic, lipit v à c a r b o h y d ra t.
C h ú n g h o ạ t động n h ư các t r u n g tâ m tá i tạo các đ ại p h â n tử lấ y t ừ ngoài
vào t ế bào v à từ các bào q u a n bị tổn thương. M ột sô" p h ả n ứ n g tr a o đổi
c h ấ t s in h r a các gốc tự do h o ạ t động m ạ n h và p eroxide h y d ro chỉ xảy ra
h ạ n c h ế tr o n g các bào q u a n có tê n gọi là peroxisom e để n g ă n c ả n c h ú n g
p h á h u ỷ các t h à n h p h ầ n c ủa tê bào. Peroxisom e c h ứ a e n z y m c a ta la s e
p h â n h u v p e ro x id e hydro: 2 H A -> 2HọO + 0 2
G l y o x y s o m e là các peroxisom e thực v ậ t c h u y ê n ho á th ự c h iệ n các
p h ả n ứ n g c ủ a ch u tr ì n h glycoxyl hóa. Lysosome, peroxisome và glyoxysome
được gọi là các vi thè.
1.2.5. Tách các bào quan
M à n g s in h c h ấ t của các tê bào eukaryote có th ể bị p h á h u ỷ bởi sốc
th ấ m t h ấ u k iế m so át sự biên d ạ n g cơ học, hoặc các c h ấ t tẩ y r ử a k h ô n g lon 13
n h ấ t đ ịn h. Các bào q u a n kích thước lốn và k h á c b iệ t về m ậ t độ. như
n h â n và ty th ể , có th ể được tá c h khỏi n h a u và tá c h k hỏi các bào q u a n
k h á c b ằ n g cách ly tă m d ự a vào hệ s ố lắ n g của chú ng . Dịch n g h iế n tê bào
được ly tâ m với tốc độ đ ủ lốn để làm lá n g các bào q u a n n ặ n g n h á t,
th ư ờ n g là n h â n . S a u đó, tá ch p h ầ n dịch b ê n t r ê n c h ứ a các b à o q u a n
k h á c đ e m ly tâ m với tốc độ đủ để làm lắ n g các ty thể, và cứ tiê p tụ c n h ư
vậy (h ìn h 1.3a). Kỹ t h u ậ t n à y cũng được sử d ụ n g để tá c h các p h â n đ o ạ n
chứ a các loại t ế b ào có kíc h thước k h á c n h a u , ví d ụ các t ế bào h ô n g câu,
bạch cầu và các tiể u h u y ế t cầu tro n g m áu. M ẫ u thô gồm các tê bào,
n h â n và ty th ể n à y c ầ n được tiếp tục làm sạch b ằ n g p h ư ơ n g p h á p ly tà m
g r a d ie n t n ồ n g độ. Kỹ t h u ậ t n à y c ũn g còn được d ù n g đê tá c h các bào
q u a n có m ậ t độ giông n h a u . T ro n g kỹ th u ậ t ly tâ m p h ă n l ừ n g theo tốc độ
lắng, h ỗ n hợp được sắp xếp t h à n h lớp, chồng lên n h a u do g r a d ie n t nồng
độ định s ẫ n c ủ a d u n g môi sử dụng. Các b ă n g (h a y các v ù n g ) c h ứ a các
t h à n h p h ầ n k h á c n h a u lắ n g xuống với tốc độ k h á c n h a u p h ụ th u ộ c vào
hệ số lắ n g c ủ a c h ú n g và tá c h n h a u r a (h ìn h 1.3b). M ục đích sử d ụ n g
g r a d ie n t n ồ n g độ c ủ a d u n g môi là n g ă n cản sự h o à tr ộ n đôi lư u c ủ a các
t h à n h p h ầ n s a u k h i đ ã tá c h r a và đ ả m bảo tốc độ lắ n g t u y ế n tí n h của
các t h à n h p h ầ n (nó b ù gia tốc cho các t h à n h p h ầ n k h i c h ú n g lắ n g tiêp
xuống p h ía dưới ông n ghiệm ). T ro n g kỹ t h u ậ t ly tâ m câ n b ă n g , g r a d i e n t
nồng độ mở rộ n g tới m ậ t độ. cao hơn m ậ t độ của m ột, ho ặc n h i ề u t h à n h
p h ầ n c ủa h ỗ n hợp để cho các t h à n h p h ầ n đó tiế n đ ế n t r ạ n g t h á i cân
b ằ n g tạ i đ iể m b ằ n g với m ậ t độ riê n g của c h ú n g v à d ừ n g lại. T ro n g
trư ờ n g hợp này , g r a d ie n t nồn g độ có th ể được xác đ ịn h trư ớ c v à h ỗ n hợp
xếp th à n h lớp b ê n trê n , hoặc tự đ ịnh h ìn h, tro n g đó m ẫ u h o à tr ộ n với v ậ t
c h ấ t g ra d ie n t (h ìn h 1.3c). G ra d ie n t nồng độ được tạ o t h à n h từ các c h ấ t
n h ư sucrose, ficoll (p o lysaccan t tổng hợp), hoặc chloride c e s iu m (CsCl) để
tách axit nucleic. T ín h tin h k h iế t của các p h â n đ oạn dưới t ế bào có thể
được xác đ ịn h b ằ n g k ín h h iể n vi điện tử, hoặc đ á n h giá h o ạ t t í n h en zy m
liên k ế t đặc h iệ u VỚI bào q u a n đó. ví dụ succin ate d e h y d ro g e n a s e ỏ tv th ê U V — í ổ n g ƠI ảm 1 • -
T h à n h p h á n ch u yể n
T h à n h p h â n c h u y ể n • _ V à t đ ổ o r * . ễ đ ổ n g c h â m n h á t o s : ^ ấ p n n ấ ĩ ■ V * . ” ° • . ° ’ - ^ • *. *• — ► • • • s r a
T h a n h p h à n c h u y ê n T h a m p h á n c h u y ể n , • W đòng nhanh đ ồ n g rvhanh n h á t ____ * '< 3 ay 0,
Hin h 1.3. Kỹ th u ậ t ly tâm
a) Ly tâm tách; b) Ly tâm phản vùng theo tốc độ lắng; c) Ly tâm cả n bầp.g 14
1ế3. CÁC ĐẠI PHÂN TỬ
1ế3.1. Protein và axit nucleic
P r o te m là các polvme gồm các axit am in liên k ê t với n h a u bởi liên k ê t
peptit. P ro tein có cả vai trò về cấu trúc và chức năng. Các axit nucleic.
ADN và ARN, là các polyme gồm các nucleotit. Mỗi n u c leo tit được cấu tạo
từ m ột bazơ nitơ. dường pentose và axit phosphoric. Các a x it nucleic làm
n h iệ m vụ bảo q u ả n và tru y ề n thông tin di tru yền . T uy nhiên, sự biếu hiện
của th ô n g tin di tr u y ề n cần có sự th a m gia của protein.
1.3.2. Các polysaccarit
Các p o ly s a c c a rit là các polvme gồm các đường đơn liên k ê t đồng hoá
tr ị b ằ n g liên k ế t glvcosit. Chức n ă n g của c h ú n g ch ủ y ế u là dự tr ữ đường
d in h dưỡng và là các v ậ t liệu cấu trúc. Ceỉlulose (h ìn h 1.4a) v à t in h bột
là t h à n h p h ầ n chiếm số lượng lớn ở thực vật. C h ú n g đề u là các polyme
n h ú n g k h á c n h a u về ph ư ơ n g thức liên k ế t các m on om e glucose với n h a u .
Cellulose là polym e m ạ c h th ẳ n g với các liên k ế t p (1 - 4) (h ìn h 1.4a) và
là t h à n h p h ầ n c ấ u tạo c h ín h của t h à n h t ế bào th ự c v ậ t. Có k h o ả n g 40
chuỗi v à t ấ m liên k ế t với n h a u b ằ n g liên k ế t h y d ro để tạ o t h à n h sợi dai,
k h ô n g t a n tr o n g nước. T in h bột là nguồn dự tr ữ đường v à được tìm th ấ v
ỏ d ạ n g các h ạ t b ê n tro n g t ế bào, các h ạ t n à y có th ê n h a n h chóng bị th u ỷ
p h â n để giải p h ó n g glucose cho quá t r ì n h tra o đổi c h ấ t. H ạ t t i n h bột
c h ứ a h a i t h à n h p h ầ n : a - am ylose - polym e m ạ c h t h ẳ n g với các liên
k ế t a (1 - 4) v à a m y lo p e c tin - polym e p h â n n h á n h với các liê n k ế t p h ụ
a (1 — 6 ). C h ứ a tới 10G gôc glucose, các a m y lo p e ctin là m ộ t tr o n g số
n h ữ n g p h â n tử lớn n h ấ t đã được biêt. N h ữ n g k iể u liên k ế t k h á c n h a u ở
tin h bột tạ o n ê n c ấ u h ìn h v ặ n xoắn kh ô n g th ể xếp c h ặ t lại được n ê n tin h
bột ta n tron g nước. N ấ m và một sô mô động v ậ t (như g an và cơ) dự trữ
glueose dưới d ạ n g glycogen - polyme p h â n n h á n h giông n h ư amylopectin).
C h itin được tìm t h ấ y ỏ t h à n h tê bào n ấ m và ở bộ xương n goài c ủ a côn
t r ù n g và loài giáp xác. Nó giông với cellulose n h ư n g các m o n o m e c ủ a nó
N - a c e ty lg lu c o s a m in e . M ucopolysaccarit (glycosam inoglyean) tạo n ê n
d ư n g dịch giông n h ư keo tro n g đó có đính xen kẽ các p ro te in d ạ n g sợi
củ a mô liên k êt. Việc xác đ ịn h cấu trúc c ủ a các p o ly s a c c a r it lớn k h á
phức tạ p vì c h ú n g k h ô n g đồng n h ấ t về t h à n h p h ầ n v à kích thước, v à vì
k h ô n g th ể n g h iê n cứu được c h ú n g về m ặ t di t r u y ề n học n h ư các a x it nucleic và p ro te in . 15 6ÇH2OH 6c h 2o h 6ç h 2o h 6 C H 2O H - o - O H - O h HO, H H H OH H OH O H JT
OH J S L0' J o X H OH H OH H OH H O H G l u c o s e n G lu c o s e G lu c o s e G l u c o s e a) b)
Hinh 1.4. a) c ấ u trúc của ce llu lose với c á c liên kết ß (1-> 4); b) Tinh bột u - a m y lo s e với c á c
liên kết « (1-> 4); C á c n gu yê n tử carbon 1, 4 và 6 được đánh dấu. C á c liên kết phu u (1-> 6)
tạo nên c á c nhánh ở amylopectin và glyc ogen . 1.3.3. Lipit
T ừ n g p h â n tử lip it cụ th ể k h ô n g t h ậ t sự là đ ạ i p h â n tử n h ư n g n h iề u
p h â n tử lip it được c ấ u tạ o t ừ các đơn p h â n n h ỏ hơn và t h a m g ia vào sự
cấu t h à n h các đ ại p h â n tử. Các p h â n tử lip it lớn c h ủ y ê u là các
h y d ro c a rb o n tr o n g tự n h iê n và ít t a n tro n g nước. M ột s ố t h a m gia vào dự
tr ữ và v ậ n c h u y ể n n ă n g lượng tro n g k h i m ột số’ k h á c là n h ữ n g t h à n h
p h ầ n cơ b ả n c ấ u t h à n h m àn g, vỏ bảo vệ và các c ấ u tr ú c t ế b à o k h á c.
Glycerit có một, hai, hoặc b a chuỗi dài các a x it béo e s te h o á với p h â n tử
glycerol, ở các trig ly c e rit động vật, các a x it béo k h ô n g có các liê n k ế t đôi
(no) n ê n có chuỗi th ẳ n g , p h â n tử có th ể b ao gói c h ặ t v à c h ấ t béo ỏ d ạ n g
rắ n . D ầ u th ự c v ậ t c h ứ a các a x it béo k h ô n g no với m ột, ho ặc n h i ề u liên
k ế t đôi. C ấ u tr ú c có góc c ạ n h c ủ a các chuỗi n à y c ả n trở việc b a o gói c h ặ t
nê n c h ú n g có xu t h ế ở d ạ n g lỏng ỏ n h i ệ t độ ph òn g. M à n g t ế b à o có c h ứ a
các p h o s p h o lip it được cấu tạo
từ glycerol e ste h o á với h a i Axt
a x it béo và a x it phosphoric. I ^
H2C — o — C — (CH2)7CH = C H ( C H 2)7CH2
P h o s p h a t e c ũ n g th ư ờ n g bị
e ste h o á t h à n h n h ữ n g p h â n tử Glycero1
. HC— o — c — (CH2)15CH3 I I X
nhỏ n h ư serine, ethanolamine, H2ẹ <~1 r X 0 Axit stearic 1 inositol, hoặc choline (h ìn h
o — p — o — CH2CH2N(C
1.5). M à n g t ế b à o c ũ n g c h ứ a \ \ o ChcLr
các sphingoỉipit n h ư ceram it. Axit phosphoric
tro n g đó chuỗi a m in o alcohol
sp h in g o sin e có m ộ t a x it béo
H ình 1.5. P h o s p h o lip it điến hinh'
liên k ế t b ằ n g liên k ê t a m it. Sự
p h o s p h a tid y lc h o lin e chứa các axit s t e a r i c
gắn k ế t c ủ a p h o s p h o c h lo rin e và o le ic este hoá
với ceramit sinh r a sphingomyelin. 16
1.3.4. Các đại phân tử phức
N h iề u đ ại p h â n tử chứa hơn m ột loại đại p h â n tử s in h học liên k ê t
VỚI n h a u th e o k iể u cộng hoá trị, hoặc k hô n g cộng hoá trị. Đ iều đó làm
t ă n g đ á n g k ể k h ả n ă n g h o ạ t động chức n ă n g hoặc c ấ u tr ú c c ủ a phức hệ.
Ví dụ, h ầ u h ế t các enzym đều là protein, n h ư n g m ộ t sô e n zy m có ARN
đóng vai trò q u a n trọ n g đối với h o ạ t tín h xúc tác g ắ n vào b ằ n g liên k ế t
k h ô n g cộng h o á trị. Sự k ế t hợp axit nucleic và p ro te in tạ o n ên
nucleoprotein. Ví dụ n h ư telomerase, enzym ch ịu tr á c h n h iệ m tá i b ả n
các đ ầ u m ú t c ủ a các n h iễ m sắc th ể e u k a ry o te và ribonuclease p , e n zym
h o à n th iệ n A RN v ậ n ch u y ển (tARN). ở te lo m e ra se , ARN h o ạ t động
giông n h ư chiếc k h u ô n để tổng hợp đoạn cuối c ủ a ADN, tro n g k h i ở
rib o n u c le ase . A R N c h ứ a vị tr í xúc tác của enzym . R ib o n u c lea se p là m ột
ví dụ về ribozym e.
G l y c o p r o t e i n c h ứ a cả pro te in và c a r b o h y d ra t (chiếm k h o ả n g < 1%
đế n > 90% khôi lượng); glycosit hoá là d ạ n g p h ổ b iế n n h ấ t c ủ a các
p ro te in đã được s ử a đổi s a u dịch mã. C a r b o h y d ra t lu ô n liê n k ế t cộng hoá
t r ị với bề m ặ t c ủ a p ro te in , m à khôn g
liên k ế t b ê n tr o n g p ro te in và thườ ng
có c ấ u tr ú c b iế n động, tạ o n ê n tín h
k h ô n g đồn g n h ấ t ở mức độ nhỏ (hình
1.6). Đ iều đó là m cho việc n ghiên cứu
các glycopro tein trở n ê n khó kh ă n .
Các glycop ro tein có chức n ă n g mỏ
rộ n g p h ổ h o ạ t tí n h c ủ a các pro te in và Protein Carbohydrate
th ư ờ n g được tìm t h ấ y ở ngoại bào.
H ìn h 1.6. C âu trú c củ a g ly c o p ro te in .
C h ú n g là t h à n h p h ầ n q u a n trọ n g của
Những biểu tượng kh ác nhau th ể hiện
m à n g t ế bào v à giúp các tê bào n h ậ n
các đơn vị m o n o s a c c a rit kh ác n hau (ví
dụ g a la c to se , N - a c e ty lg lu c o s a m in e ) b iế t n h a u .
P r o t e o g l y c a n là các phức hệ p ro te in và m u c o p o ly s a c c a rit lớn (>107
Da), được tìm th ấ y ỏ t h à n h tê bào vi k h u ẩ n và k h o ả n g k h ô n g g ia n ngoại
bào c ủ a các mô liê n kêt. Các đơn vị đưòng c ủa c h ú n g th ư ờ n g có n h ó m
s u lfa te là m cho c h ú n g có tín h h y d r a t hoá cao. H iệ n tư ợ n g đó cộng với độ
dài c ủ a c h ú n g ( > 1 0 0 0 đơn vị) là m cho d u n g dịch có độ n h ớ t cao.
P ro teo g ly ca n h o ạ t dộn g n h ư các c h ấ t bôi trơ n v à c h ấ t tiế p n h ậ n n h ữ n g
t h a y đổi tr o n g k h o ả n g k h ô n g gian ngoại bào.
Các p h â n tư p r o t e i n liên k ế t l i p i t có c h ứ a lipit liên k ế t cộng hoá 17
trị. T h à n h p h ầ n lip it th ư ờ n g là acyl béo (như m y risto y l hoặc palm itoyl),
hoặc n h ó m iso p re n o id (n h ư fa rn e sy l hoặc g e ra n y lg e ra n y l). Các n h ó m
n à y h o ạ t động n h ư n h ữ n g chiếc mỏ neo cắm p ro te in vào m à n g th ô n g q u a
tư ơ n g tá c kỵ nước VỚI lip it tr ê n m àng và tă n g cường liên k ế t p r o te in - protein.
T ro n g các p h â n tử l i p o p r o t e i n , lipit và p ro te in liê n k ế t k h ô n g cộng
hoá trị. Vì lip it ít t a n tro n g nước n ê n chúnp được v ậ n c h u y ể n tr o n g m á u
dưới d ạ n g lip o p ro tein . Các lipoprotein cơ b ả n là các h ạ t tr ig ly c e r it và
e ste cholesterol, được bao bọc bởi lớp vỏ p h o sp h o lip it, c h o le s te ro l và
p ro te in (apo lipoprotein). Các apolipo protein có cấu tr ú c để các a x it a m in
kỵ nưốc c ủa c h ú n g hư ớ n g vào các lip it bên tro n g h ạ t, tr o n g k h i các a x it
a m in p h â n cực v à tíc h đ iệ n hư ớ ng r a bên ngoài môi trư ờ n g. Đ iê u đó làm
cho các h ạ t n à y t a n được tro n g nước.
Các g l y c o l i p i t bao gồm các cereb ro sit v à g a n g lio s it có các t h à n h
p h ầ n lip it v à c a r b o h y d r a t liên k ế t cộng hoá trị. C h ú n g có m ặ t n h i ề u ở
m à n g các t ế bào nã o và t h ầ n k in h.
1.4ể S ự TẬ P HỢP CÁC ĐẠI PHÂN TỬ 1.4.1Ẽ
Các phức hệ protein
Tê bào c h ứ a n h iề u phức hệ lớn gồm
n h iề u đ ạ i p h â n tử c ù n g loại hoặc k h á c loại.
N h iề u yế u tô" c ấ u tr ú c hoặc v ậ n động c h ín h
củ a .tế b à o c h ứ a các phức h ệ p ro te in . Bộ
k h u n g xư ơ n g của t ế bào là cách sắ p xếp các
sỢi p ro te in giúp đ in h h ìn h t ế bào, giúp t ế
bào v ậ n động và p h â n bố’ các bào q u a n
tro n g t ế bào. Các ui ống là các polym e dài b)
gồm các p ro te in tu b u lin , loại p ro te in h ìn h
c ầu khôi lượng p h â n tử l l O k D a (h ìn h 1.7.)
C h ú n g là t h à n h p h ầ n c h ín h của bộ k h u n g
xương và c ủ a lôn g n h u n g , lông roi - loại
cấu tr ú c giông n h ư sợi tóc t r ê n bê' m ặ t 300A (30nm)
n h iề u t ế bào, có k h ả n ă n g đậ p là m cho t ế
bào v ậ n độ ng ho ặc đẩ y c h ấ t lỏng c h ảy qua
Hình 1.7. S ơ đ õ c h o th â y (a)
m ặt cắt ngang và (b) cảu
bề m ặ t t ế bào. L ông n h u n g còn chứ a cả
trúc bể m ặt cua c á c tiếu đơn
p ro te in n e x in và dynein.
vị a và p tron g c á c vi ố n g 18